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單細胞分離和mRNA標記流程

更新時間:2025-04-15      點擊次數(shù):397
單細胞表達分析系統(tǒng)更有效的測序可以更低的成本實現(xiàn)更高的通量:由于與高通量實驗方法相關的測序成本,單細胞實驗往往非常昂貴。BD Rhapsody單細胞分析系統(tǒng)設計有多個功能,可以更有效地利用測序來降低實驗成本。
靶向測定-由于檢測靈敏度的提高,特定的基因組合方法可使用少量的時間和成本,幫助產(chǎn)生類似于全轉錄組分析(Whole Transcriptome Analysis,WTA)測定的結果。這種方法還提高了UMI計數(shù)效率,從而極大程度的節(jié)省了實驗時間和成本。
儲存-從樣本中得到的完整cDNA可在磁珠上穩(wěn)定存儲,允許將珍貴樣本保存長達16周。這可使用戶在時間允許的情況下靈活地對樣本進行測序,并通過對儲存的磁珠池進行等分或分樣來實現(xiàn)同一樣本的多個測定。
分樣-在磁珠上儲存的cDNA可以分成一個或多個等分試樣,并使用定制或預先設計的組合(panel)進行擴增。通過提供對部分樣本進行測序的選項和對樣本不同組合(panel)進行測試的靈活性,分樣可降低成本。
單細胞分離和mRNA標記流程:
1.在微孔中,一個細胞與一個條碼標記磁珠匹配
2.裂解細胞將mRNA與磁珠上條碼標記的捕獲寡核苷酸雜交
3.磁珠回收
4.cDNA合成
5.測序和構建單細胞基因表達譜
 
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